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CSHL科學家創建了遺傳 常見嫌疑人的排名列表

文章作者:www.utbltn.icu發布時間:2019-11-21瀏覽次數:2000

是什么讓我們的基因成為我們.我們不是秘密!但基因通常是導致衰弱性疾病的基礎。了解任何疾病的主要線索之一是看到哪些基因在疾病發作期間表現異常。然而,通常不清楚異常遺傳活動是否是手頭疾病所特有的,或僅僅是不健康身體的一般癥狀。冷泉港實驗室(CSHL)的科學家現已開發出一系列常見嫌疑人,這些嫌疑人可能對研究人員和臨床醫生而言非常寶貴。

“想象一個通靈者,”CSHL計算生物學家Jesse Gillis介紹道。 “當他們為觀眾做'冷讀'時,他們會說'某人在這里有戴夫或大衛的名字等等,對嗎?他們很可能猜到了。”

那一刻,觀眾沒有考慮大衛這個名字的受歡迎程度,這讓旁觀者戴夫驚艷不已。

Gillis和博士后研究員Maggie Crow指出,這項方法的陷阱在一項研究中可能存在問題,該研究比較了健康細胞的遺傳活性與疾病相關細胞的遺傳活性 - 一項名為“差異”的研究。

他們認為,如果有人預測在發現差異表達的過程中會識別哪個基因,那么該基因似乎與疾病有關,但僅僅因為它與幾乎所有疾病相關。

與不列顛哥倫比亞大學的Paul Pavlidis一起,兩人對大約27,000個樣本進行了635個數據集的計算。他們發現像Dave這樣的基因:它們可能會受到任何疾病的影響,這些疾病的出現并不令人驚訝。發現這種效應使團隊能夠識別特定條件特有的基因。

在PNAS期刊中詳述的結果“應該不會讓人大吃一驚,但準確量化它們是有價值的,”吉利斯說。 “瑪吉在這項工作中的天才正在悄然走下坡路,并說生物過程可以推動這種變化。”

Crow指出驅動炎癥的基因作為這些生物過程的一個例子。這些基因在癌癥患者中非常活躍,但在其他疾病中也是如此,例如阿爾茨海默病。這些信息嵌入在Gillis和Crow列表中,并提供了解釋這些基因的背景信息。

“我們有一個排名列表,我們正在努力使其易于使用和構建,”Crow補充道。希望新數據能夠幫助研究人員設計更好的實驗,發現新的藥物靶點,并開發各種疾病的治療方法。

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