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為大量蛋白質文庫克隆數千個基因

文章作者:www.utbltn.icu發布時間:2020-01-18瀏覽次數:1212

發現基因的功能需要克隆DNA序列并表達它。到目前為止,這是基于一個基因完成的,導致了瓶頸。羅格斯大學 - 新不倫瑞克省的科學家與約翰霍普金斯大學和哈佛醫學院合作開發了一種同時克隆數千個基因并從DNA樣本中創建大量蛋白質庫的技術,可能創造了功能基因組學的新時代。

“我們相信蛋白質和其他遺傳成分的快速,經濟,高通量克隆將大大加速生物學研究,以發現基因組編碼分子的功能,并與新的基因組測序數據出現的速度相匹配,”Biju說。羅格斯大學Parekkadan - 新不倫瑞克省生物醫學工程系副教授。

在今天發表在“自然生物醫學工程”雜志上的一項研究中,研究人員發現他們的技術LASSO(長適配器單鏈寡核苷酸)探針可以同時捕獲和克隆數千種長度。 DNA片段。

作為概念驗證,研究人員從大腸桿菌中克隆了3,000多個DNA片段,這些片段通常用作具有編目基因組序列的模式生物。

“我們捕獲了大約95%的遺傳目標,我們開始捕獲它們,其中許多長度非常大并且在過去一直是一個挑戰,”Parekkadan說。 “我認為隨著時間的推移會有更多的改進。”

他們現在可以使用基因組序列(或其中許多序列)以前所未有的速度,成本效益和精確度創建蛋白質文庫,從而快速鑒定基因組中潛在有益的生物分子。

在他們的研究中,他們巧合地解決了基因組測序領域的長期問題。當談到個體基因組的基因測序時,今天的黃金標準是逐個對小片DNA進行測序并覆蓋它們以繪制出全基因組代碼。然而,在重疊過程中很難解釋短讀取,并且無法以有針對性和有效的方式對DNA的長片段進行測序。 LASSO探針可以通過捕獲長于1,000個堿基對的DNA靶標來實現這一目標,目前的格式捕獲大約100個堿基對。

該團隊還報告了從人類微生物組樣本中捕獲和克隆第一個蛋白質文庫或蛋白質組。 Parekkadan補充說,在分子水平上去除人類微生物組是改善精準醫學的第一步,精確醫學會影響我們的腸道,皮膚和肺部的微生物區系。精準醫學需要在分子水平上深入和功能性地理解健康和疾病形成微生物群的驅動因素。

今天,制藥行業篩選了數千個分子合成化學庫,以找到可能具有藥效學效應的化學庫。 Parekkadan說,他于1月加入了羅格斯工程學院。

“我們的愿景是采用相同的方法,但要快速篩選非合成的,生物的或'天然的'分子,包括從人類或其他基因組中克隆的植物,動物和微生物分子,”他說。 “這可能導致更多努力將藥物發現轉化為生物制藥藥物。”

Parekkadan表示,下一階段的進展是改進克隆過程,建立文庫并發現我們基因組中發現的治療性蛋白質。

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