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Nat Meth:如何讓基因表達分析更快更便宜

文章作者:www.utbltn.icu發布時間:2019-09-25瀏覽次數:1024

最近,耶魯大學的一個研究小組開發了一種簡單的方法,可以顯著減少大規模基因表達分析的時間和成本。相關研究結果于3月2日在Nature的出版物《自然方法》(自然方法)上發表。

在耶魯大學醫學院放射治療助理教授Abhijit Patel的帶領下,研究小組創造了一種工具,該工具采用新一代高通量DNA測序技術,可以更容易地同時測量大量細胞或組織。基因活動。 DNA被認為是生命的藍圖。了解哪些基因在不同條件下被激活或關閉是我們理解生物學和疾病的基礎。進一步閱讀:Nature的出版物:新的計算方法大大加速了基因表達的估計。

這種稱為模塊化早期標記擴增(META)RNA的方法允許在許多樣品中同時定量各種微小RNA或mRNA,并且需要比現有數字分析技術更少的測序深度。該方法允許在逆轉錄期間分配定量標簽以在競爭性擴增和深度測序之前混合預樣品。這種簡單,可擴展且廉價的方法增加了大規模基因表達研究的效用。

基因表達分析通常用于臨床試驗。例如,在乳腺癌患者中,通常通過檢測腫瘤樣本中的基因表達來預測復發的可能性,以確定化學療法是否有益。根據Patel的說法,另一種高通量方法可用于同時測量許多患者腫瘤中的基因表達。最后,這種方法可以降低這種檢測的成本并使其更廣泛地可用。

本文的高級作者帕特爾說:“為了得出關于復雜基因表達模式的有意義的結論,通常需要對大量臨床或實驗樣本進行統計分析。我們相信這項新技術將有助于我們很興奮,因為這種方法使得大規模RNA分析對大多數研究人員和臨床實驗室來說更加實用和容易。“

該研究由耶魯癌癥中心,尊敬的Tina Brozman基金會以及國家和高級科學轉化中心的臨床和轉化科學獎資助。

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