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2015基因測序儀市場分析

文章作者:www.utbltn.icu發布時間:2019-09-02瀏覽次數:1553

2015年的下一代測序技術(NGS)取得了長期進展。技術進步使研究人員能夠獲得更長的閱讀長度序列,生物信息學將產生更豐富的基因組信息。

根據最新的DeciBio市場報告,測序儀器市場已經達到24億,預計到2019年將增長到45億。臨床客戶是這一增長的主要推動力,研究市場是由單細胞測序推動的,群體遺傳學和NGS應用。本文回顧了過去幾個主要音序制造商的發展趨勢,并展望了2016年。

逆轉PacBio:續集音序器

在過去幾年中,PacBio在RSII測序系統讀取長度,通量,生物信息學分析和應用方面做了很多改進。然而,該儀器的價格高達695,000美元,其大尺寸也阻礙了它的廣泛采用。

Sequel測序儀的推出標志著PacBio的逆轉,與RS II系統相比,其測序吞吐量增加了7倍,價格下降了350,000美元,體積僅為1/3左右。

2015年,PacBio預計將銷售10個Sequel測序儀,其中大部分銷售給羅氏,而羅氏已準備好使用Sequel進行臨床測序。續集還被西奈山伊坎醫學院的伊坎基因組學和多尺度生物學研究所和貝勒醫學院訂購。

華盛頓大學基因組學教授Shendure表示,如果Sequel的表現繼續提高,其低成本和長讀序列優勢將有助于研究人員進行更全面的突變研究。續集將有所作為。該儀器甚至提供了“鉑質基因組”,他將其定義為接近人類參考基因組的質量。

英國癌癥研究所基因組負責人詹姆斯哈德菲爾德說,如果PacBio繼續提高裝載效率并降低測序成本,它將成為真正的競爭對手。 “如果你能以5000美元的價格獲得PacBio儀器的基因組,那就太棒了。”雖然這個價格仍然比Illumina的基因組測序更昂貴,但它提供了更大范圍的長度和結構信息。

Roslin研究所ARK基因組中心主任Mick Watson預測,未來一年將Illumina測序儀與PacBio的Sequel測序儀配合使用將產生更多的全基因組測序結果,并對結構變異和短讀長技術。較少的基因組區域,例如HLA區域,重復元件和著絲粒。此外,他補充說,由于觀察結構變異的閱讀時間長,“人們將開始使用Sequel對癌癥基因組進行測序。”

然而,Bald研究所的Chad Nussbaum表示,Sequel的成功將取決于數據的質量,目前還沒有相關數據。

牛津納米孔:MinIon試驗

Oxford Nanopore去年推出了MinIon Nanopore Sequencer早期試驗計劃。從那時起,該計劃已經擴大,幾個小組已經發表了廣泛的研究,展示了MinIon在標準實驗室之外協助基因組裝配和微生物基因組和環境樣品快速測序的潛力。

美國宇航局約翰遜航天中心的研究人員計劃于2016年將MinIon帶到太空,以便對國際空間站的樣本進行測序。一些研究人員認為,MinIon可用于即時檢測(POCT),例如,快速檢測以診斷未知感染,以及對西非埃博拉病毒爆發等疾病爆發的實時分析。

牛津能否超越PacBio還有待觀察。 Watson說PacBio擁有客戶群和成熟的技術。 MinIon和即將到來的PromethIon仍處于開發階段,但牛津的技術潛力巨大。

華大基因的戰略變化

6月,Huada Gene推出了基于CompleteGenomics技術的高通量測序儀Revolocity。當時,Complete Genomics的首席執行官Cliff Reid表示,Revolocity每年可以測序10,000個人類基因組,相當于Illumina的HiSeq X Ten。雖然華達基因計劃在2016年上半年推出Revolocity測序儀,但它提前有三個客戶:荷蘭奈梅亨大學醫療中心,澳大利亞健康服務公司Mater和英國癲癇協會。

但是在11月,Huada Gene放棄了測序系統的商業化。 Reid將辭去Complete Genomics的首席執行官一職,該公司的重點是臺式機測序儀BGISEQ-500,計劃通過中國食品藥品監督管理局的認證。這是王軍離開后華大基因經歷的又一次重大變化。

沃森推測,Revolocity對于商業化來說可能過于復雜。

Thermo Fisher:改善服務

基于Ion Torrent技術,賽默飛世爾科技推出了一種新的NGS系統,即 Ion S5,專注于“即插即用”靶向測序。該公司還開發了基于AmpliSeq技術的靶板,特別是針對癌癥領域。展望未來,有針對性的測序可能是Thermo Scientific的一個有利可圖的方向,并且正在努力實現擴展Proton測序儀的目標。

DeciBio的市場報告指出,由于PII芯片面臨技術困難,賽默飛世爾的市場份額有所下降。隨著公司將重點從增加產量轉移到改善服務臨床客戶的工作流程,其增長將以每年約17%的速度增長。

2016年預測

展望2016年,單細胞測序技術的進展,10X基因組學的技術潛力以及大規模測序項目產生的基因組數據令研究人員興奮不已。

Shendure說:“捕獲,分區和標記方面的技術進步非常快,可以告訴我們哪些序列來自同一個細胞。”這些技術包括10X Genomics技術,可快速分析數千個單細胞表達譜的Rapid-Seq技術,以及由Shendure Laboratories開發的CPT-seq技術,可創建數千個標記的DNA庫。

哈德菲爾德討論了單細胞基因組學,基因組定位和自動化。他說:“這些技術使我們能夠構思出更復雜的實驗,是我期待的下一次技術革命。”

幾個臨床測序項目正在進行中。 Shendure說:“監管挑戰變得越來越明顯。找到最合適的患者方法的最重要方法是在2016年取得進展。”

此外,Illumina仍然是NGS市場的主要參與者,但由于MiSeq和NextSeq測序儀的銷售不佳,其第三季度的收益并不如預期。專家預測Illumina將在2016年進行重大創新。

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