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“大數據+基因測序”助推腫瘤靶向藥物研發

文章作者:www.utbltn.icu發布時間:2019-12-18瀏覽次數:659

基因測序可為腫瘤的早期篩查,早期診斷和藥物開發提供重要依據,為腫瘤精準醫學的實施奠定基礎。近日,“百度 - 協和醫學院食管癌研究項目”在北京協和醫學院舉行了簽約儀式。雙方將充分發揮北京協和醫學院的醫學研究優勢和百度大數據與人工智能的技術優勢,發現它們與中國人息息相關。早期診斷食管癌的相關標志物為食管癌的早期篩查和診斷提供了科學依據,為食管癌靶向藥物的開發提供了依據。

生物標志物和目標研究迫在眉睫

據估計,全世界超過50%的食管癌患者在中國。由于缺乏早期診斷標志,大多數患者被發現是先進的,而且缺乏有效的臨床治療藥物,患者的5年生存率僅為10%左右。

分子腫瘤學國家重點實驗室研究員,博士生導師劉志華說:“目前,歐洲和美國的食管癌研究對中國的醫學界沒有太大的參考價值。因此,測序和對食管癌全基因組進行了功能研究,以找出食管癌早期診斷的生物標志物和藥物靶點。“

中國工程院院士,分子腫瘤學國家重點實驗室主任詹啟民說:“由于缺乏早期診斷標志物,中國食管癌的臨床治療效果不佳。事實上,進步當今的技術已經使許多癌癥已經可用。更有效的藥物控制,但食道癌在靶向藥物治療中幾乎是空白。“

據了解,分子靶向治療通過作用于腫瘤細胞的特定靶標而在多種腫瘤中顯示出良好的功效。在食管癌的治療中,一些藥物已經臨床探索和應用。實際上,EGFR,HER2 +和其他途徑的靶向藥物的大多數II期和III期臨床研究都令人失望。此外,一些新的靶向藥物的結果值得期待。目前,大多數與食管癌相關的靶向研究來自西方人群的食管腺癌或食管胃癌。國內數據相對稀少。預計尼妥珠單抗在中國的臨床研究將帶來令人振奮的結果。

需要深入探索互聯網以改變醫療保健

事實上,中國對食管癌基因測序和基因突變的研究已經悄然進行。近年來,由詹啟民領導的中國醫學科學院腫瘤醫院分子腫瘤學國家重點實驗室研究團隊與華大基因和汕頭大學醫學院的研究人員合作,對高通量測序進行了分析。和比較基因組雜交芯片。學習功能和臨床驗證研究系統地揭示了食管鱗狀細胞癌的基因突變背景,并發現了與食管鱗狀細胞癌的發展和臨床預后相關的基因。

根據詹啟民的研究,潛在治療靶點的分析顯示,PI3K是食管鱗狀細胞癌突變頻率最高的潛在藥物靶點,并發現了潛在的新藥靶點,如PSMD2,RARRES1,SRC,GSK3β和SGK3。據悉,2014年5月1日,《自然》雜志正式公布了上述重大科技成果。

據了解,“百度 - 協和醫學院食管癌研究項目”由北京協和醫學院分子腫瘤學國家重點實驗室實施。根據計劃,合作項目將于2016年初開始,完成1500例食管癌患者組織樣本的采集,兩年內收集100個食管癌家系的血樣,完成整個項目的測序和生物分析。 2017.工作。

詹啟民認為,最有效的癌癥預防和治療措施是早期篩查和早期診斷。協和與百度合作,目前1500個樣本分析的數據量是世界上最大的。

此外,食管癌的醫學研究需要在全基因組測序和比較過程中獲得大量數據。這些數據的存儲,生物分析和臨床相關性分析需要巨大的數據存儲和計算能力。

“基因測序產生的數據需要大量的存儲空間,測序后的處理和分析需要強大的計算資源。這些功能是百度擅長的。此外,百度在分布式計算方法和算法方面有著深刻的積累。百度研究院副院長張偉表示,這將有助于測序結果對比分析的效率和有效性。

在中國大力推廣精準醫學的背景下,“互聯網+醫療”已成為一種熟悉的組合。對此,張偉認為:“目前,很多'互聯網+醫療'的做法和嘗試,水平相對較淺。例如,現在更加實踐的注冊平臺,角色是連接人和醫院,但注冊資源本身是有限的,最后是數字給誰,你需要更聰明。“

“至于如何利用互聯網技術改變醫療保健,如精準醫療,個性化醫療,甚至未來的智能診斷,智能醫療,這些仍處于起步階段。”張偉進一步說。

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