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基因表達研究揭示了非洲沙門氏菌的新亮點

文章作者:www.utbltn.icu發布時間:2019-12-30瀏覽次數:600

利物浦大學的科學家向前邁進了一步,了解導致沙門氏菌嚴重流行的細菌,沙門氏菌目前每年在撒哈拉以南非洲造成大約40萬人死亡。

發表在PLOS Biology期刊上并代表了五年的工作,綜合生物學研究所的研究人員完成了迄今為止最大的細菌比較基因表達研究之一。

當通常引起胃腸疾病的沙門氏菌進入血液并通過身體傳播時,就會發生侵襲性非傷寒性沙門氏菌病(iNTS)。非洲iNTS流行病是由抗生素抗性鼠傷寒沙門氏菌(ST313)變種引起的,該病毒通常影響免疫系統受瘧疾或HIV損害的個體。

研究作者RocíoCanalsAlvarez博士解釋說:“盡管非洲和世界上鼠傷寒沙門氏菌的基因組有95%相同,但剩下的5%是非常不同的。”“這些差異中的大多數不會引起基因表達的變化,但我們需要識別影響基因表達的遺傳變化,并可能影響人類細菌感染的結果。“

為了發現這些關鍵的遺傳差異,研究人員在致命的非洲沙門氏菌和常見的“全球”胃腸炎版本之間進行了大規模的比較轉錄組學方法。

研究人員以16種不同的方式培訓了每種沙門氏菌菌株,代表了人類感染過程的不同階段。他們還從小鼠巨噬細胞中分離出沙門氏菌 - 細菌在感染期間用來劫持宿主的免疫細胞。

通過研究非洲和世界范圍內鼠傷寒沙門氏菌在這些不同條件下的轉錄組,他們發現677個基因和小RNA在兩種菌株之間表達不同。

平行蛋白質組學方法鑒定了導致蛋白質水平改變的基因表達差異。兩個棱鏡驗證實驗揭示了非洲沙門氏菌發育不良的遺傳基礎,并發現了一種新的細菌質粒維持系統。

為了使世界各地的研究人員能夠使用新信息,新數據以用戶友好的在線工具(SalComD基因表達譜)呈現。

“這項研究將轉錄組學的力量提升到新的細菌水平。我們的“功能轉錄組”方法與廣大受眾相關,可應用于許多其他生物。分析管道和社區數據資源是常見的,可以激發其他人使用類似的方法來回答他們的研究問題,“負責這項研究的Jay Hinton教授補充說。

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